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2023年4月19日发(作者:猫和老鼠3gp下载)牦牛皮蝇幼虫的RF下雪的诗句唯美 LP快速鉴定
作者:刘浩浩,李玉萍,黄志宏,等
来源:《湖北农业科学》 2012年第7期
刘浩浩1,李玉萍2,黄志宏1,徐亚欧1,金素钰1,林亚秋1,郑玉才1
(1.西南民族大学生命科学与技术学院,成都 610041;2.四川省九龙县农牧局,
四川 九龙 622000)
摘要:从牦牛皮下采集皮蝇(Hypoderma)幼虫,用DNA提取试剂盒、Che
lex-100两种方法提取幼虫的基因组DNA;通过PCR扩增线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ
基因(COⅠ)中的高度可变序列,扩增产物经BfaⅠ酶切后用琼脂糖凝胶检测,结果表明
所采集的皮蝇幼虫属于同一种。测序结果显示,扩增的序列与GenBank中中华皮蝇(H.
sinense)相应序列的相似性为99.56%,表明所采集的皮蝇幼虫均为中华皮蝇。
关键词:牦牛;皮蝇(Hypoderma)幼虫;RFLP;细胞色素氧化酶Ⅰ;鉴定
中图分类号:S852.74+3
文隹怎么读 献标识码:A
文章编号:0439-8114(2012)07-1477-04
牦牛皮蝇蛆病是牦牛中常见的一种寄生虫病,该病发病率高,尤其是在1~2岁的幼龄牦
牛中[1]。被皮蝇幼虫感染的牦牛会出现产奶量下降、体重减少等症状,另外皮革的质量也
会受损,这将严重影响藏区畜牧业的发展[2,3]。因此,加强该病的监测及防治工作非常
重要。侵袭牦牛的皮蝇种类有很多,在我国主要有中华皮蝇(Hypoderma sinen
se)、牛皮蝇(H. bovis)、纹皮蝇(H. lineatum)3种[1,2],
其中又以中华皮蝇最为常见。有资料统计,在藏区患皮蝇蛆病的牦牛中,大约有90%是被中
华皮蝇感染,剩余两种皮蝇各占5%左右[4]。
皮蝇种类的鉴定方法已经有很多,最常见的是通过形态学特征与分子生物学特征鉴定。前
者主要是用扫描电子显微镜观察皮蝇3期幼虫气门板的形态以及体节腹面突棘的分布情况[1,
2,5],后者则是根据线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)[1,4-7]、核糖体28 S
亚基[1]等基因的序列特征。虽然不同种类的皮蝇幼虫形态有一些差异,但是形态学鉴定需
要扫描电子显微镜等大型设备,操作不是很方便。本研究使用分子生物学方法,改良皮蝇幼虫
DNA的提取方法,进行RFLP及测序分析鉴定采集到的牦牛皮蝇幼虫,以期建立一种快速、
可靠的牦牛皮蝇幼虫鉴定方法。
1 材料与方法
1.1 样品的采集
牦牛皮蝇幼虫采自四川省九龙县,在牦牛屠宰时采集4头牦牛的皮下幼虫(n=11),
迅速冰冻,送至实验室后保存于-80 ℃超低温冰箱。
1.2 主要仪器及试剂
主要仪器:电动匀浆器(瑞士Polytron PT1200E)、Mastercyc
ler EP梯度PCR仪(Eppendorf)、Power Pac 3000电泳仪(B
io-Rad)、Versa Doc 1000凝胶成像系统(Bio-Rad)。主要试剂:
TaKaRa基因组DNA提取试剂盒(宝生物工程(大连)有限公司)、2Taq Mas
ter Mix(天根生化科技(北京)有限公司)、Chelex-100(Bio-Ra
d)、BfaⅠ(Ferments)等,引物由上海英骏生物技术有限公司合成。
1.3 皮蝇幼虫DNA的提取
牦牛皮蝇2期或3期幼虫称重后,加入10倍体积匀浆液(0.01 mol/L Tri
s-Cl,pH 8.0),用电动匀浆器在冰上匀浆,9 330 r/min 4 ℃离心20
min,上清液保存于-80 ℃备用。
采用两种方法提取牦牛皮蝇幼虫DNA。①取皮蝇幼虫匀浆液250 L,参照TaKa
Ra基因组DNA提取试剂盒从全血中提取DNA的方法进行;②参照Amills等[8]
的Chelex-100方法,取幼虫匀浆液200 L,用50 g/L的Chelex-
100提取DNA。提取的DNA用琼脂糖凝胶电泳检测,并用核酸蛋白检测仪测定其浓度。
1.4 皮蝇幼虫的分子生物学鉴定
使用Otranto等[7]设计的引物UEA7(5′-TACAG
TTGGAATAGACGTTGATAC-3′)和UEA10(5′-TCC
AATGCACTAATCTGCCATATTA-3′)扩增皮蝇幼虫细胞色素氧化酶
Ⅰ基因(COⅠ)中编码第四外环到羧基端(E4-COOH)的片段。PCR体系包括:2
Taq Master Mix 12.5 L,超纯水8 L,DNA模板2.5 L,1
0 mol/L UEA7和UEA10 各1 L。PCR扩增程序为:94 ℃ 12 mi
n;94 ℃ 1 min,60 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,38个循环;72 ℃ 7
min;16 ℃保存[5]。扩增产物用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,同时选取1个PC
R产物直接进行双向测序。
PCR扩增产物用限制性内切酶BfaⅠ酶切,反应体系包括PCR产物2.5 L,超
纯水15 L,Buffer 2 L,BfaⅠ 0.5 L。37 ℃酶切11 h后用
2.0%的琼脂糖凝胶电泳检测。
2 结果与分析
2.1 皮蝇幼虫COⅠ基因的PCR扩增结果
皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR扩增结果见图1。其中1~3号D
NA为试剂盒法提取,4~6号DNA由Chelex-100法提取,二者扩增效果相同,
均获得了单一的、长约700 bp的条带。
2.2 皮蝇幼虫COⅠ基因PCR产物酶切
皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR产物经BfaⅠ酶切、电泳检测显示,所
有个体均获得了2条大小分别约为420 bp和270 bp的条带(图2),表明采集的皮
蝇幼虫均属于同一种。
2.3 皮蝇幼虫COⅠ基因PCR产物的测序及比对结果
选取1只皮蝇幼虫COⅠ基因编码E4-COOH片段的PCR产物进行慌的组词 双向测序,拼接后与G
enBank中中华皮蝇、牛皮蝇、纹皮蝇COⅠ基因中编码E4-COOH片段的序列(G
enBank登录号分别为:AY350769、AF497761、AF497762)进
行比对(图3)。结果发现该序列与中华皮蝇的相应序列只有3个碱基的差异,差异位点分别
为63、339、544,两者序列一致性达到了99.56%;而与牛皮蝇、纹皮蝇则分别
有60个、47个碱基的差异,相应的序列一致性分别为91.28%、93.17%,表明
本试验所采集的牦牛皮蝇幼虫均为中华皮蝇。
3 讨论
有报道显示,在青藏高原牧区患皮蝇蛆病的牦牛中,大约有90%是由于中华皮蝇的感染
[4]。本研究根据皮蝇幼虫COⅠ基因中编码E4-COOH片段的RFLP分析以及序列
比对结果,并参考Otrant兢兢业业 o等呢喃的拼音 [1]的研究结果,证实所采集的牦牛皮蝇幼虫均为中华
皮蝇,与之前的报道相符[4,9]。用分子生物学方法鉴定牦牛皮蝇种类的相关研究已有不
少报道[1,4-7,9],该法在其他动物的皮蝇幼虫鉴定中也获得了可靠的结果[10-
12]。与形态学方法相比,分子生物学方法结果准确可靠,操作也较简单,同时不需要大型
仪器设备,应用前景广阔。
本研究在皮蝇幼虫DNA的提取过程中采用Chelex-100方法,取得了很好的效
果。该方法提取的DNA用作PCR模板时,与试剂盒提取DNA的效果相差不大,但该法操
作简单、成本低、污染小,尤其适合高通量的DNA提取。这为今后牦牛皮蝇幼虫的大规模鉴
定提供了可靠、有效的方法。
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