结构关系指通过语序和虚词反映出来的各种语法关系，例如主谓关系、动宾关系等。这种结构关系是显性的。相同的结构层次，包含不同的结构关系，这也是造成句法结构歧义的一个因素。结构关系不同的歧义结构也可以用层次分析法分析。
　　例如以下短语都可以做两种切分：
　　（1）进口软件：动宾／偏正
　　（2）机关商店：联合／偏正
　　（3）天上的星星，地上的街灯：联合／主谓
　　（4）玩到杭州：复句／补充

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造成句法歧义的因素——结构关系不同